文津阁《四库全书》具有独特的历史文献价值。首先，从七部《四库全书》的成书时间看，文津阁是北方四阁中最后完成的一部，距第一部文渊阁《四库全书》成书已有三年之久，这其中对已发现的讹误、遗漏当有所补正。 其次，从历史上看，《四库全书》成书后曾作过两次全面复查，而这两次复查，文津阁本都是由总纂官纪昀亲自带领有关人员进行的。文津阁本是档案明确记载曾经乾隆亲校，并由纪昀亲自三校的抄本。现经核查原藏，几乎每册均有校核纪录，其编校质量优于包括文渊阁本在内的其他诸本。第三，就现世仅存的三部半《四库全书》看，由于文津阁本保存最为完整，因此其他三阁本均分别据文津阁本加以补抄。1917年，贮存于清内务府的文渊阁本经检查发现有9种书缺佚，共缺23卷，当时就据文津阁本予以补抄。1934年，藏于沈阳的文溯阁本，也发现有缺卷，即特派人到北京据文津阁本补抄了《挥麈录》等三书。至于杭州文澜阁，由于原书散失严重，缺佚过半，据文津阁本补抄的更是不计其数。
20世纪80年代，台湾商务印书馆影印出版文渊阁《四库全书》后，国家图书馆研究员杨讷先生于1991年提议并主持了文渊阁《四库全书》影印本与文津阁《四库全书》原书核对录异工作，取得了可喜的成果。从已进行核对的集部和史部看，集部收书共计1,273种，存有差异788种，占62%；史部收书共计566种，存有差异290种，占51%。这些差异包括：篇、卷之差，文字之差，《永乐大典》辑佚本的差异，序、跋、附录的差异，提要的差异，等等。通过核对录异还发现，文津阁《四库全书》所保存下来的一些文献资料竟是海内孤篇。这些成果引起了海内外学者的高度重视。
文津阁《四库全书》是采用全数字化制作生产并取得完全成功的最大文化工程，先后得到过温家宝总理、李长春、刘云山等领导的视察。
2012年，扬州国书文化传播有限公司研发并实现全球唯一采用手工宣纸，运用激光数码彩色印刷，进行大规模全书原大、原样、原色印制工程，这是人类文化史上最庞大的文化出版工程，也是中华民族伟大复兴的标志性工程。
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一批具有20年以上古籍装订经验的工人，按照《四库全书》的要求恢复了包背装这种特殊的传统装订工艺。选用5A级100%的天然蚕丝为原料，用现代生产技术同传统工艺相结合的生产工艺，生产出高品质耿娟并采用环保染色技术，染成《四库全书》所需要的4种颜色装订而成。
